More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3618 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  77.63 
 
 		 153 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  55.24 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.46 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  38.55 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  33.02 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  27.74 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  29.27 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  34.95 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  33.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 314 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>