246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0638 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 169 aa  340  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  85.88 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  76.71 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  79.02 
 
 		 144 aa  236  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 148 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 148 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 148 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 148 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  70.14 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  63.31 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  50.34 
 
 		 153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  43.66 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.09 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.85 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  36.05 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.97 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  33.72 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  34.34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  44.29 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>