More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6072 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  95.27 
 
 
148 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  93.92 
 
 
148 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  93.92 
 
 
148 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  91.89 
 
 
148 aa  283  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  91.84 
 
 
157 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
148 aa  277  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  244  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  79.72 
 
 
144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  72.34 
 
 
169 aa  217  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  70.21 
 
 
170 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 
156 aa  209  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  63.38 
 
 
165 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  63.38 
 
 
165 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  61.38 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
153 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  32 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
155 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  31.31 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.67 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.92 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  40.3 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  34.65 
 
 
195 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  32.47 
 
 
144 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 
144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 
144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 
144 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
149 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>