More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2794 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  97.97 
 
 		 148 aa  297  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  95.92 
 
 		 148 aa  290  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  91.84 
 
 		 148 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  94.41 
 
 		 148 aa  279  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 144 aa  234  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  70.21 
 
 		 169 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  63.38 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  63.38 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  63.31 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  36.05 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  30.91 
 
 		 214 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  34.65 
 
 		 195 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>