174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1424 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  43.06 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 		 173 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25.44 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  25 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  23.93 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.15 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 244 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  34.29 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  25.24 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  19.3 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  25 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  23.24 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>