More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0479 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  39.42 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  39.42 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 307 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 320 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 329 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 326 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.68 
 
 		 312 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 		 349 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 349 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 347 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 340 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 340 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.94 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.27 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.01 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32.61 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.83 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.73 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 337 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  27.93 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 305 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.26 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  28.26 
 
 		 319 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  40.91 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.21 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 310 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 321 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  29.73 
 
 		 312 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>