47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0521 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  290  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  94 
 
 		 150 aa  274  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3318  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  19.42 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  26.32 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  17.39 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  29.82 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  17.73 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  19.55 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  19.72 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  19.84 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 188 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  19.26 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 155 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  23.26 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  18.05 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 186 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  22.43 
 
 		 161 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 159 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 144 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>