117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1198 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 183 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.55 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 325 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  26.53 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4177  regulatory protein MarR  31.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  31.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 329 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.64 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  29.5 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.22 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 139 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 178 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 186 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 260 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 146 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 186 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  31.13 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  27.12 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 139 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 174 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  30.26 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  30.88 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.77 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  23.01 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>