187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1503 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  52.27 
 
 		 184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  47.31 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  24.86 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.21 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  29.7 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  23.39 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  24.04 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  28.47 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  24.8 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  23.97 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 134 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>