More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1037 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 174 aa  340  5e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  36.3 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.01 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  28 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.73 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.73 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.02 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  26.5 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25.53 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>