139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1651 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  98.77 
 
 		 162 aa  323  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  96.91 
 
 		 162 aa  319  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  63.69 
 
 		 174 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  63.82 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  56.79 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.03 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  43.21 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.56 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.71 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  26.13 
 
 		 132 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  33.85 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.42 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 140 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>