47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3648 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  31.3 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.65 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  25.24 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  20.69 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  20.69 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  34.94 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  34.44 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.11 
 
 		 326 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  30.11 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  36.54 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  34.55 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 267 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>