122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3512 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  36.54 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  34 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  33.01 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  28.81 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 161 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  31.4 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  32.84 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  35.35 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  29.01 
 
 		 135 aa  44.7  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.89 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 149 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>