170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2777 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  312  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  47.89 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  40.28 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.6 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.07 
 
 		 324 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  21.48 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  21.48 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  22.64 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.47 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  21.48 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  32.08 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  42.59 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  22.81 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>