92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1316 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  318  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  34.67 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.77 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 315 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  24.03 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 145 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 174 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 149 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 172 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 142 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 142 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 188 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 142 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  28.24 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  28 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  26.47 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  20.34 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.7 
 
 		 152 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  23.47 
 
 		 156 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>