More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4274 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  33.73 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  33.73 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  29.73 
 
 		 157 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  38.3 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  41.98 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.51 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0360  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  42.31 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  47.06 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  44.59 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>