More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2485 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 149 aa  294  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  94.2 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  71.03 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 149 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  71.63 
 
 		 149 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 149 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 149 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 151 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.89 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  29.56 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  29.46 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.98 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  26.99 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  29.1 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  30.43 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>