182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4598 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  90.8 
 
 		 163 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 165 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  85.28 
 
 		 162 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  82.21 
 
 		 162 aa  267  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  52.86 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.66 
 
 		 150 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.64 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.1 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.5 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  31.15 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 166 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 169 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.49 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.49 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.49 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.49 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  30.7 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.98 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  29.7 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  29.91 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>