222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3783 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  98.72 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 189 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 189 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  31.25 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>