69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0295 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  28.69 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 329 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  27.45 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  23.78 
 
 		 165 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 325 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 161 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>