255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1933 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 184 aa  358  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 153 aa  90.9  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 		 155 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  45.57 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  39.74 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  42.5 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  32.48 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.24 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  27.44 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.3 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  36.56 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  37.33 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  29.29 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>