137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3411 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  72 
 
 
157 aa  228  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  69.13 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  69.8 
 
 
156 aa  218  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  68.46 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  67.95 
 
 
157 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
174 aa  142  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
150 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 
152 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  28.83 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  27.27 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.49 
 
 
138 aa  57.4  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
174 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
139 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  26.8 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  26.83 
 
 
135 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  25.53 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 
150 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 
135 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  19.73 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  20.26 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  21.64 
 
 
309 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  22.52 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  21.67 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
154 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>