224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0259 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 161 aa  66.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  29.07 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0728  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33.68 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>