154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0749 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  26.67 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.93 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.1 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  43.4 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  43.4 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  43.4 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  27.88 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  43.4 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  43.4 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  23.65 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  22.46 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.13 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  26.85 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  24.24 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  26.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  23.24 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  22.14 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  32.79 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>