89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2438 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 329 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  21.48 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  25.84 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  31.53 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  22.81 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0270  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 174 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  23.71 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>