89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2420 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  43.66 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  41.67 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  41.56 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1949  transcriptional regulator TcaR  29.89 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 177 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 154 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 145 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 220 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  28.97 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  31.71 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.47 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 144 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>