123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2332 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1846  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 146 aa  163  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  22.12 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  26.92 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.92 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  20.51 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.92 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 324 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.92 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.59 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  20.66 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  21.15 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 140 aa  43.5  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  29.27 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  20.15 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  27.52 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  18.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 153 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 154 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 181 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 152 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 141 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 145 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 319 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25.64 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 147 aa  40.8  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.21 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>