More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2106 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
163 aa  322  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  48.84 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  41.59 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
140 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  35.51 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.27 
 
 
287 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  33.88 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  24.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  27.27 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  24.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  30.7 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  33.33 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
145 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30.94 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  37.38 
 
 
155 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
167 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
145 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
175 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
163 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
154 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.48 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  23.48 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>