111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1645 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  356  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  96.36 
 
 
179 aa  329  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  95.76 
 
 
237 aa  326  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  62.11 
 
 
174 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
160 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  60.54 
 
 
163 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  61.27 
 
 
163 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  58.27 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
183 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
191 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  50 
 
 
191 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  52.05 
 
 
187 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 
172 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 
182 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  54.19 
 
 
183 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 
186 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 
169 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
185 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
226 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
185 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 
179 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
181 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  47.01 
 
 
168 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 
179 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
170 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
169 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
172 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.74 
 
 
167 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
151 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  36.97 
 
 
151 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
158 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
160 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
160 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
160 aa  85.1  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
145 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  39.32 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
177 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
321 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
336 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
321 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
329 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  42.59 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
146 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
146 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
174 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
146 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>