131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1738 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  78.18 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 185 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  74.85 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  76.07 
 
 		 182 aa  235  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  56.21 
 
 		 184 aa  170  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  59.21 
 
 		 191 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  59.21 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  64.39 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  56.08 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  57.34 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  56.64 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 179 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 237 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  54.41 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 		 148 aa  94  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 151 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  35.34 
 
 		 151 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.69 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 326 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  24.79 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.77 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  24.46 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  20.74 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  25.86 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 325 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  19.42 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>