115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0413 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 233 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  21.74 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  36.76 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  23.6 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  22.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  22.73 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  25.26 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.41 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.41 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.41 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.41 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.41 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  24.21 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  26.85 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 161 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 150 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 155 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  21.01 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  26.21 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>