107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2601 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  342  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  80 
 
 		 169 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  73.33 
 
 		 168 aa  247  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  69.46 
 
 		 170 aa  236  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  74.17 
 
 		 169 aa  228  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  80.65 
 
 		 169 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 226 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  48.09 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  51.59 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 191 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  50.39 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  55.24 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  39.07 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 237 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  45.67 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 145 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.68 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  33.04 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  26.92 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  40.4 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  37.7 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 146 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 147 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  38.1 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32.18 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>