108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1520 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
179 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 
237 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  96.36 
 
 
173 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  65.33 
 
 
174 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 
163 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 
160 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  60.56 
 
 
163 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  58.27 
 
 
154 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  49.1 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 
184 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  52.6 
 
 
182 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  54.43 
 
 
187 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  50.3 
 
 
191 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  50.3 
 
 
191 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 
169 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 
172 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  56.49 
 
 
183 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
186 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
185 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
226 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
169 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 
179 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  46.27 
 
 
168 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
170 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
169 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
172 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
146 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
158 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.74 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  36.97 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
160 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
160 aa  87.8  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
158 aa  87.8  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
145 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  38.26 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 
143 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
168 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
321 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
142 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  44.3  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  42.59 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  27.83 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
326 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
336 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
154 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.51 
 
 
139 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
154 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
146 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
146 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
161 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>