91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0093 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  78.48 
 
 
168 aa  254  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  76.4 
 
 
169 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  75.16 
 
 
169 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  73.21 
 
 
170 aa  245  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  77.64 
 
 
169 aa  217  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  74.17 
 
 
172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
179 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
172 aa  151  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
175 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
172 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
183 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
160 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  50.77 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
226 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 
163 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 
163 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
174 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
158 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  54.29 
 
 
191 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  54.29 
 
 
191 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  51.3 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  48.82 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
157 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
186 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
237 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  43.51 
 
 
179 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  45.51 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
148 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
185 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  44.35 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
147 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
160 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  33.06 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
325 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
326 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
326 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
326 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  34.68 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
326 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
141 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
336 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  43.28 
 
 
158 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>