88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2925 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  77.84 
 
 		 169 aa  267  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 169 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  75.95 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 169 aa  245  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  80.65 
 
 		 169 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  69.46 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  49.61 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  42.34 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  48.82 
 
 		 187 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  52.83 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  52.83 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 237 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 145 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  50.51 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  42.97 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  36.29 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  36.36 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  30.12 
 
 		 319 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.92 
 
 		 319 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 141 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 138 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  23.96 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>