83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1139 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  98.82 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  95.57 
 
 		 169 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 170 aa  264  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  75.16 
 
 		 169 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  74.1 
 
 		 168 aa  247  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 172 aa  208  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 226 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  51.18 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  53.33 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 147 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  39.84 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.68 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  33.64 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 325 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.67 
 
 		 319 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 152 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 144 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  35.44 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 336 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 326 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>