110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4070 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  73.49 
 
 
191 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  73.49 
 
 
191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  74.07 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  73.94 
 
 
226 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  72.73 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  62.42 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
174 aa  170  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 
182 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  58 
 
 
183 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
169 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  57.53 
 
 
185 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
186 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
169 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
185 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  53.55 
 
 
172 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 
179 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 
173 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
237 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  60.31 
 
 
160 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  54.73 
 
 
163 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  54.73 
 
 
163 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  57.36 
 
 
154 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  51.88 
 
 
168 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
170 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
179 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
169 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
172 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
169 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
175 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  59.14 
 
 
172 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 
167 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 
167 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
158 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
157 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
160 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
160 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
158 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  42.42 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
145 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.32 
 
 
148 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  40.91 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.37 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.11 
 
 
305 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
143 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  30.18 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  29.73 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  29.36 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.48 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
182 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
150 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.14 
 
 
157 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.14 
 
 
157 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>