89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2672 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  74.47 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  73.05 
 
 		 148 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  73.24 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  46.97 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  46.97 
 
 		 160 aa  129  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  46.97 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  48.76 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  48.76 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 169 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  38.28 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  39.13 
 
 		 191 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 191 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 169 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 226 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 175 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 172 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 184 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  37.21 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 183 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  34.81 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 237 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 179 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 181 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 163 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 340 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 326 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 340 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 349 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.46 
 
 		 349 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.58 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 193 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  23.96 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 347 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 137 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>