109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3300 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 169 aa  254  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  75.3 
 
 		 169 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 170 aa  249  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  74.1 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  59.05 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  59.05 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  59.05 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  52.76 
 
 		 154 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  45.96 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  43.15 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  43.15 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  46.34 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  49.07 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  49.07 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  35.38 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.31 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  32.32 
 
 		 319 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  31.31 
 
 		 319 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25.93 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  20.87 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.08 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  22.64 
 
 		 146 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 175 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>