88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4469 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  53.64 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  38.81 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  46.34 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.5 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  24.27 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.96 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  31.18 
 
 		 312 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  29.46 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 152 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 146 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 154 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 334 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 117 aa  40.8  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 337 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0857  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 294 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  30.11 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>