63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3835 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.23 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  23.96 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  44 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  37.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  23.28 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  30.16 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.57 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 306 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.3 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 166 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 144 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 161 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 154 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>