293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4895 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4895  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  313  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0351  helix-turn-helix, Fis-type  50.88 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  36.11 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  38.96 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.14 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.1 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  22.99 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25.81 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  30.68 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  28.43 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  39.71 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.53 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  30.99 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  30.12 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  29.58 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 313 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>