More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6917 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
157 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
171 aa  87.8  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  41.73 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
171 aa  85.1  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.93 
 
 
161 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
178 aa  84  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  40 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.5 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  38.06 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.97 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
191 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
198 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
212 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
192 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  45.07 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>