166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1031 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  296  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 
143 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  21.09 
 
 
172 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  34.75 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  43.06 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
200 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
153 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  32.26 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  29 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  34.78 
 
 
195 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.88 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.65 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.27 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.75 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  34.52 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  34.04 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  35.64 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.6 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  44 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.47 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  33.73 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
233 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>