254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02203 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  86.86 
 
 		 138 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  86.86 
 
 		 138 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  51.45 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.33 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  28.95 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  34.59 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.59 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  46.55 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  38.03 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  25.17 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.3 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  35.38 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  40.68 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>