140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1592 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 		 179 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 		 179 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 179 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 179 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  98.37 
 
 		 144 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  31.88 
 
 		 149 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 164 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 159 aa  89  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 154 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 159 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1978  MarR family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 43 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.536119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.97 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 161 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 170 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  30.66 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  32.62 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30 
 
 		 147 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30 
 
 		 147 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.03 
 
 		 137 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 169 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 144 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 164 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  27.01 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 141 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 161 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 144 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 152 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  22.58 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 168 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>