249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2122 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  352  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 304 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 304 aa  343  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  247  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  33.33 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 154 aa  90.9  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 160 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1978  MarR family transcriptional regulator  97.67 
 
 		 43 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.536119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.97 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.84 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.51 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.51 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  27.74 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 140 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.78 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  32.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  24.03 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>