191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0294 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  340  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  48.37 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  31.72 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.57 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 304 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  27.27 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  30.84 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.41 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  30.09 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  22.58 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.68 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>