242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3177 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.4 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  30.4 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.52 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 303 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  31.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  30.68 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.97 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.8 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  28.8 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>