80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1334 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
148 aa  291  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  44.78 
 
 
147 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
147 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  36.94 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  39.66 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  31.85 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  25.93 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  25 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  24.07 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  27.16 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
191 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  20.26 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  21.92 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  21.23 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 
147 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
183 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
144 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  23.15 
 
 
144 aa  42  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  21.48 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  28.21 
 
 
160 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  21.57 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  19.46 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  22.58 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
212 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  20.37 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  21.59 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
137 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
160 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 
145 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
160 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>